Prof. Dr. Alper İlki, Yapı ve Deprem Mühendisliği alanında çalışmalarını sürdürmekte olup, 1993 yılından bu yana İstanbul Teknik Üniversitesi İnşaat Fakültesi, İnşaat Mühendisliği Bölümü'nde görev yapmaktadır.

Avrupa Birliği, NATO, TÜBİTAK ve JICA destekli çeşitli uluslararası ve ulusal araştırma projelerinde yürütücü ve araştırmacı olarak yer almış olan İlki'nin bu projeler kapsamında hazırlanmış 100’den fazla uluslararası makalesi ve 300’den fazla uluslararası konferans bildirisi yayınlanmıştır. Akademik çalışmaları çerçevesinde 20 doktora ve 75'i aşkın yüksek lisans tezine danışmanlık yapmıştır.

Türkiye Bina Deprem Yönetmeliği, Hasar Tespit Yönetmeliği, Güçlendirme Yönetmeliği ve Riskli Yapı Tespit Esasları'nın hazırlanma süreçlerine katkıda bulunan İlki; Türkiye Deprem Vakfı Yönetim Kurulu, AFAD Deprem Danışma Kurulu ve KKTC Cumhurbaşkanlığı Deprem Komitesi üyeliklerini sürdürmektedir.

Bunların yanı sıra Edirne Selimiye Cami, İstanbul Ayasofya Cami, Sivas Divriği Ulu Cami, Bukoleon Sarayı, Antakya Habibi Neccar Cami, Antakya Ulu Cami, Lefkoşa Ayasofya Camii ve Gazimağusa Lala Mustafa Paşa Camii gibi tarihi eserlerin restorasyon bilim kurullarında görev almış ve almaya devam etmektedir